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Jun 24, 2023

イネのカスパリアン帯膜ドメインの結合と栄養ホメオスタシスには新しいタンパク質ファミリーが必要である

Nature Plants (2023)この記事を引用します。メトリクスの詳細細胞間接合は、多細胞生物が栄養の恒常性を維持するために不可欠です。 植物型タイトジャンクション、カスパリアンストリップ

Nature Plants (2023)この記事を引用

メトリクスの詳細

細胞間の接合は、多細胞生物が栄養の恒常性を維持するために不可欠です。 隣接する内胚葉細胞間の傍細胞空間を密閉する植物型の密着結合であるカスパリアンストリップ（CS）-カスパリアンストリップ膜ドメイン（CSD）は、100年以上前から知られています。 ただし、この構造の分子基盤は不明のままです。 今回我々は、グリシン/アラニン/プロリンに富むドメイン、レクチンドメイン、分泌シグナルペプチドを含む新しいタンパク質ファミリー（GAPLESS）がイネのCSへの原形質膜の係留を媒介することを報告する。 GAPLESS タンパク質は根内胚葉細胞の CS に特異的に局在しており、その機能が失われると細胞間接合が障害され、栄養のホメオスタシスが破壊されます。 GAPLESS タンパク質は細胞膜内で OsCASP1 と緊密な複合体を形成し、それによって CS-CSD 結合を媒介します。 この研究は、植物内胚葉細胞の結合複合体に関する貴重な洞察を提供し、作物の栄養ホメオスタシスと真核生物の細胞結合についての理解に光を当てます。

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この研究で使用したデータとデータベース: AtCASP1 (uniprot ID:Q9SIH4) および OsCASP1 (uniprot ID:Q7XPU9) のアルファフォールド モデル。 ドメイン予測: InterPro (v.92.0、IPR036426)。 RNA-seq データベース: http://ipf.sustech.edu.cn/pub/ricerna/。 イネの根の単細胞データベースは http://www.elabcaas.cn/rcar/index.html から取得しました。 同定された配列のシグナルペプチドは、SignalP (https://services.healthtech.dtu.dk/service.php?SignalP) を使用して検証されました。 配列 BLAST は、PLAZA データベース (https://bioinformatics.psb.ugent.be/plaza) に対して検索されました。 共発現ネットワークの生成に使用されるコードは、GitHub (https://github.com/Yorks0n/Os_endo_network) で入手できます。 追加情報は、リクエストに応じて対応著者から入手できます。 ソースデータはこのペーパーに付属しています。

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